2016年12月13日清晨，南京大屠杀死难者国家公祭日升国旗和降半旗仪式在主教楼前广场举行。校党委委员、副校长余新卫，校团委副书记王璜，团委老师及青年学生代表参加了此次仪式。

伴随着响亮的口号声，校国旗护卫队迈着整齐一致的步伐，护送着国旗进场。升国旗、奏国歌、敬礼，国旗在阴沉的天气里显得格外鲜艳。升旗仪式结束后，国旗又徐徐半降，大家集体脱帽，默哀三分钟，以此缅怀南京大屠杀的无辜死难者，缅怀所有惨遭日本侵略者杀戮的死难同胞，缅怀为中国人民抗日战争胜利献出生命的革命先烈和民族英雄。

最后，学生代表彭玉莹在国旗下宣读《致全校青年学生倡议书》，倡议作为一名大学生，我们要做到铭记历史，勿忘国耻；敬畏生命，珍视和平；以史为鉴，自强不息。